Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFDNP55196 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms