Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NKX2-5P52952 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NKX2-5P52952 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKX2-5P52952 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms