Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA4P48058 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms