Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms