Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTGS1P23219 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms