Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms