Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms