Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL3P10147 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL3P10147 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL3P10147 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms