Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTNSO60931 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms