Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOBOXO60393 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOBOXO60393 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NOBOXO60393 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOBOXO60393 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms