Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCO2O43819 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms