Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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CEP290O15078 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CEP290O15078 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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CEP290O15078 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP290O15078 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP290O15078 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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