Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
KIF3BO15066 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms