Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms