Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms