Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC160A6NGH7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms