Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPDC1A2A3K4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms