Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms