Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MAP3K4Q9Y6R4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms