Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXND1Q9Y4D7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXND1Q9Y4D7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms