Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF8Q9UPP1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms