Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SS18L2Q9UHA2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms