Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms