Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD3Q9UBI1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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