Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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