Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHPF2Q9P2E5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms