Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DNAJC28Q9NX36 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms