Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CLSTN2Q9H4D0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLSTN2Q9H4D0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms