Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRINP2Q9C0B6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRINP2Q9C0B6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms