Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRXQ9BXM0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRXQ9BXM0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms