Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MGME1Q9BQP7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MGME1Q9BQP7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms