Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCNX1Q96RV3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNX1Q96RV3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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