Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLIN4Q96Q06 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms