Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL15Q96M94 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms