Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRRC1Q96M27 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms