Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TPD52L3Q96J77 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms