Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms