Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMTM5Q96DZ9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms