Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TM4SF18Q96CE8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms