Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSAQ969W0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms