Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HJURPQ8NCD3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms