Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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