Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP13Q86W25 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 396.3 ms