Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRRC8EQ6NSJ5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRRC8EQ6NSJ5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms