Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE12Q6L8Q7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms