Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms