Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBAP2Q5T6F2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBAP2Q5T6F2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms