Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D1BQ5T0F9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms