Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RPL39P5Q59GN2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPL39P5Q59GN2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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