Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms